Мальчик-подросток идет по крыше, собираясь спрыгнуть с нее, но неожиданно изображение обрывается - герой просыпается в маленькой комнате. Вновь пытаясь покончить жизнь самоубийством, он оказывается в торговом центре. Затем - на ферме, дома, в тюрьме. Это продолжается до тех пор, пока Билли не "просыпается" в возрасте около 20-ти лет в большой комнате с людьми, которые начинают с ним разговаривать и успокаивать его. Главный герой продолжает "засыпать" и "просыпаться", но при этом он понимает, что все это время находится в больнице.
Разговаривая с врачами и адвокатами, он постепенно узнает, что обвиняется в изнасилованиях и грабежах, но был переведен из тюрьмы в больницу. Врачи установили Билли диагноз "множественной личности", чем и объяснялись его неожиданные появления в разных местах. Постепенно свыкаясь с этой мыслью, Билли все чаще общается с людьми, знакомится со своими остальными личностями. В результате лечения было выявлено 24 личности в теле Билли Миллигана, одна из которых совершила изнасилвания, а вторая - грабежи.
Со временем Билли научился полностью контролировать себя и свои "выходы". Врачи решают начать процесс слияния всех личностей. Зритель наблюдает за постоянными "переключениями" с одной личности на другую, которые пытаются договориться друг с другом, а позже - объединиться. В результате долгого лечения все личности в теле Билли Миллигана сливаются в одного человека, которому от каждой личности переходит какое-то умение, талант или привычка.
После лечения Билли Миллигана переводят обратно в тюрьму для ожидания суда. В результате подсудимого оправдывают по причине невменяемости и отправляют в больницу для дальнейшего лечения.
Этот фильм - не история о Билли Миллигане, а Билли Миллиган в этой истории. Первая часть фильма полностью идет от первого лица, то есть зритель видит все глазами главного героя: точно так же не понимает, что с ним происходит, почему он просыпается в разных местах, как перемещается в пространстве. Таким образом "сумасшествие" главного героя переносится на зрителя.